K dobré teorii: COVID-19. Analýza vývoje/52

27. červen 2020 | 01.00 |
blog › 
K dobré teorii: COVID-19. Analýza vývoje/52

V tomto pokračování ukazuji význam modelů a jak se porovnávají se realitou. Shrnutí poznatků o mutování viru.

Do seriálu o dobré teorii zařazuji "retro" – připomenutí toho, jak jsem společně s kolegy, s nimiž dlouhodobě spolupracuji, i s těmi, se kterými jsem postupně navázal kontakt, analyzoval aktuální vývoj. Sleduji tím dvojí:

- Ukázat, jak je důležitý interdisciplinární přístup a týmová práce, tj. že dobrá teorie hodně dokáže. (To si každý může ověřit porovnání toho, co jsme říkali před měsícem s tím, co se odehrává nyní.)

- Trochu oživit krátkodobou paměť, protože někteří zapomínají až příliš rychle.


COVI-kávička 27.5: 48 nových případů. Komentář

27. květen 2020
Zdroj: https://radimvalencik.pise.cz/7919-covi-kavicka-27-5-48-novych-pripadu-komentar.htmlZdroj: https://radimvalencik.pise.cz/7915-covi-kavicka-26-5-47-novych-pripadu-komentar.htm

48 (+1 oproti předcházejícímu dnu) nových případů za 26. 5. Návrat k velmi nízkým hodnotám.

Mírný vzrůst počtu hospitalizovaných ke dni 25. 5. na 154 (+6) oproti předcházejícímu dni.

Jak to vidím

Chvála diskusní skupiny Covid_19philosophy:

Začnu chválou diskusní skupiny Covid_19philosophy na FB. Zde je na ni odkaz:

https://www.facebook.com/groups/208008770285228/

Sešla se tam řada odborně fundovaných lidí, kteří pravidelně sledují určité oblasti odborného dění v zahraničí i u nás, a srozumitelně o svých poznatcích informují ostatní. To by jednotlivec sám nezvládnul. Vznikl tak vlastně jakýsi neformální tvůrčí tým, který do toho, co se v souvislosti s nákazou odehrává, vidí nezaujatě a na velmi solidní úrovni.

Tak jsem se například díky Matěji Šustrovi dostal k zajímavým článkům o bádání v oblasti mutací koronaviru. O takto získaných poznatcích jsem informoval ve svém pravidelném seriálu zde:

https://radimvalencik.pise.cz/7914-covi-kavicka-25-5-65-novych-pripadu-komentar.html

Nové poznatky podstatným způsobem upřesňují to, jak se virus chová. Ukazují na to, že mutace patrně nehrají tak významnou roli v chování viru, jak se zdálo.

Nový virus však patrně mění své chování:

Přesto patrně k výrazné proměně (trochu obdobné, k jaké došlo v případě SARS, tedy přesněji SARS-CoV, tento virus je SARS-CoV-2) chování nového viru dochází. Například ke dni 23. 5. jsme zaznamenali další významný pokles počtu hospitalizovaných na 145 (-11) oproti předcházejícímu dni, což jsou při stejném počtu nakažených menší než poloviční počty než na začátku epidemie. Na pouhých 24 (-5 oproti předcházejícímu dni) se snížil i počet těžkých případů. Deset dnů před tím to bylo 217 a 42, od té doby (ale i do té doby) při větším počtu aktuálně nakažených obě čísla neustále klesají. Fakt, který je nutné vysvětlit.

Dobře je to vidět na tomto obrázku:


Těžké případy – červená lomená linie.

Lehčí případy – modrá lomená linie.

Přitom počet aktuálně nakažených se už delší dobu příliš nemění a dokonce ani neklesá.


Horní obrys červené plochy.

To nelze vysvětlit jen lepší připraveností lékařů. Zdá se, jako by se virus "polepšil". Vzhledem k tomu, že role mutací patrně není významná, je to spíše "ochočením" viru než jeho "šlechtěním", viz dříve:

https://radimvalencik.pise.cz/7909-vyslechtit-nebo-ochocit-covid-19-tot-otazka.html

Dal jsem si práci a namátkově se podíval na jiné země (je to piplačka, protože grafické vyvedení jsem nenašel) a je to obdobné. I tam, kde virus "zdivočel" dochází k jeho "polepšení". Úbytek hospitalizací a těžkých případů, a to i při srovnatelném či dokonce větším počtu nakažených, nelze vysvětlit ani pokrokem v oblasti léčebných metod, ani lepší technikou a širším záběrem testování, které je schopno zachytit i dříve "neviditelné" či "přehlížené" případy. S naším virem se zkrátka něco děje.

Může to být sluníčkem, může to být epidemiologickými opatřeními, ale může to být i vývojem kmene SARS-CoV-2.

O metodologii tvorby modelů (resp. konceptů):

Dříve, než se pokusím dát vysvětlení, odhalím něco z "kuchyně" tvorby modelů. Variací základního modelu teorie evolučních her, které vycházejí v hry typu "vězňovo dilema" či blízkého typu hry "tragédie společné pastviny" a které rozšiřují původní model tím, že se jedná o hry s velkým množstvím opakování, je obrovské množství. Liší se v mnoha "maličkost", ale dávají výrazně odlišné výsledky. Přitom variace modelů jsou vícedimenzionální, tj. liší se od sebe v mnoha různých směrech.

Vzhledem k tomu, že modelů, kterými lze modelovat (například v našem případě) chování viru je obrovské množství, nemá smysl pokoušet se o předčasné kvantifikace. Lépe je pracovat s určitou představou, tu vyjádřit pojmy a formou myšlenkového experimentu takto vytvořený koncept konfrontovat s realitou. Vyžaduje to znalost modelů, určitou invenci a sledování poznatků z různých, z často velmi různých oblastí. Když má člověk štěstí, nachází je odborně "natrávené" třeba právě na stránkách nějaké diskusní skupiny. Většina oficiálních zdrojů je totiž příliš úzce zaměřena.

K materiálům, které pro skupinu získal Matěj Šustr:

Pokusím se nyní stručně interpretovat, co znamenají poznatky, které zprostředkoval Matěj Šustr. Do jeho původních podkladů vkládám svou interpretaci:

1. Přestože virus se replikuje na bázi RNA, je evolučně velmi stabilní.

2. Mutace jsou jen "bodové", tj. mění se jen jednotlivé báze, případně jejich malé sekvence.

3. Drobné mutace mutují i zpětně, takže virus při replikacích spíše "osciluje" kolem základní stabilní struktury.

4. Zatím se neprokázalo, že by vznikly vývojově odlišné stabilní mutace, které by si uchovaly svou odlišnost a vedly ke změně chování.

Co z toho vyplývá a jak vysvětlit chování viru:

Jedním z možných vysvětlení je, že si náš virus žárlivě střeží svoji "kmenovou čistotu" a tím si uchovává dlouhodobou evoluční stabilitu i na bází RNA (která je vůči mutacím méně stabilní než DNA).

To je možné. Jak neustále připomínám, předchůdci našeho viru tu byli patrně ještě před dinosaury. Virus je "vymakaný". Jeho základní strategie je založena na kooperativním řešení hry typu "tragédie společné pastviny" s opakováním.

Vsuvka: Kmen "člověk" ještě takto "vymakanou" strategii pro tuto hru nemá, i když v jednodušších společnost ji již zvládá. Elinor Ostrom za porovnání modelů s empirickými daty právě v této oblasti dostala v roce 2009 Nobelovu cenu za ekonomii, viz:

https://cs.wikipedia.org/wiki/Elinor_Ostrom

Člověk má oproti našemu viru ještě co dohánět.

Trochu na odlehčení - Praha po výjimečném stavu, autentické svědectví:

Praha 25. května v podvečer. Všude roušky. Natruc Šmuclerovi, Šafrovi, Schmarzcovi, vzkaz: "Vy jste ovce, my ne!"

Tak jsem zašel k Jelínkům – nejslavnější hospoda v Praze. "Když ti žízeň v krku kouše, dej si pivo u Bouhouše!" Právě sem nejraději chodil Hašek. Plno. Ale odstupy se dodržují. Nenecháme si pokazit to, co se podařilo. Bohoušovi kryt sluší, už čtyřicet let točí pivo na jeden zátah:

Dokonce omládal (možná, že při karanténě trochu přibral a to mu vyhladilo vrásky). 47 korun v centru Prahy. Kurňa - ta koruna je hodně tvrdá měna.

Jinak – plno celbrit. Ale těch, kteří umí, považují se za normální lidi a necítí potřebu se prosazovat. Poznáte je?

Nálada skvělá. Je těžké odpoutat se od kultovního místa na cestu domů.

Mj. i vzhledem k tomu se cítím bezpečněji. Tady je riziko opravdu malé. Zvlášť, kdy se lidé chovají více zodpovědně, než by se čekalo.

Co se děje ve světě:

Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:

https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Další významné zdroje o dění ve světě:

https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441

https://ourworldindata.org/coronavirus

První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.

Graf šíření mutuací

https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114

Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:

https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19?fbclid=IwAR3kdxZhYD7krsZ_K-xrmwNkGlQMO5rsIjQe_0jAWZT___jH_9pV_KzA38c

Nejdůležitější je tento graf:

Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
(Pokračování)

Zpět na hlavní stranu blogu

Hodnocení

1 · 2 · 3 · 4 · 5
známka: 1 (2x)
známkování jako ve škole: 1 = nejlepší, 5 = nejhorší

Komentáře

 zatím nebyl vložen žádný komentář