COVI-kávička 2.6.: RF +9035 US +22153. Komentář

U nás, jak se zdá, je koronavirus již plně pod kontrolou a "ochočen" (nepropukají zdivočelé vícenákazy). Pokud nedojde k recidivě (a tu zatím nepředpokládám do uvolnění pohybu osob a případné "repatriaci" nové vícenákazy), není nijak zvlášť přínosné sledovat situaci v ČR. Pokud dojde ke změně, včas zareaguji. Proto je dobré zaměřit pozornost na ty země, kde se koronavirus ještě nedaří nejen ochočit, ale ani zkrotit.

Ruská federace: +9035 nových případů (o 209 menší přírůstek než předcházející den). Po delší době druhý den více než 9 tisíc.

Spojené státy:    +22153 nových případů (o 1803 větší přírůstek než předcházející den). Dostalo se zase nahodnoty přes 20 tisíc.

Uvedené dva státy jsem si vybral k dennímu sledování nejen proto, že jsou největší, ale i proto, že v nich došlo k největšímu rozbujení vícenákaz. Bude zajímavé sledovat, jak se zde bude situace vyvíjet. Je to příběh s otevřeným koncem a hodně napoví o tom, jak náš virus funguje.

U obou zemí zatím žádný náznak toho, že by lineární nárůst nově nemocných nepokračoval.

Pokud srovnáváme jednotlivé země mezi sebou, je nutné uvažovat různou metodiku a další faktory, které výsledek ovlivňují (např. počet testů). K tomu se postupně dostanu. Důležité je však právě průběžně sledování, protože z časových řad lze vyčíst hodně i při odlišných metodikách.

Informace čerpám zejména z: https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Jak to vidím

Logika evolučního chování COVID-19

Vpotu tváře (nepřeháním) a s využitím konceptů teorie evolučních her se snažím co nejrychleji vytvořit testovatelný model, který by umožnil dát odpověď na otázku, zda nebezpečné jsou jen vícenákazy koronavirem, které vyvolávají "excitovaný" stav našeho viru a jeho nekooperativní chování ve vztahu ke svým soukmenovcům. O co jde, jsem formou otázek (alternativ, hypotéz) popsal zde:

https://radimvalencik.pise.cz/7934-covi-kavicka-31-5-5-rf-8952-us-23290-komentar.html

Dnes se pokusím o názorné vyjádření:

Výše uvedená schémata vychází z hypotézy, že dokud nedojde k vícenákaze a probuzení nekooperativního chování jedné mírně (bodově?) odlišné mutace od druhé, je náš virus téměř neviditelný. Nejen pro nás, ale i pro bílé krvinky. Nereagují na něj a tudíž ani nevytvářejí protilátky.  Může se šířit (replikovat) mezi lidmi, aniž bychom to při běžných testech zaznamenali.

"Viditelnou" stopu (reakci bílých krvinek, vytváření protilátek, příznaky nemoci) může vyvolat až excitovaný stav, při kterém jednotlivé mírně odlišné mutace začínají soupeřit mezi sebou. Nemoc COVID-19 je primárně projevem evoluční hry uvnitř kmene našeho viru, nikoli mezi člověkem a virem.

V tom případě může dojít i k paradoxu "zlého viru": Náš virus je přirozenou selekcí naprogramován k evoluční stabilitě, jejímž základem je kooperativní chování ve vztahu k soukmenovcům. Aby tuto dlouhodobou evoluční strategii uhájil, spouští nekooperativní (vůči svému hostiteli) agresivní chování v případě, kdy se setká se soukmenovcem, který porušil "tabu" kmene a začal se chovat nekooperativně, tj. tak, že se rychle množí (a ohrožuje svého hostitele).

Má k tomu dva důvody:

a) Omezuje tím populaci mírně mutovaného nekooperujícího soukmenovce, protože vlastním excitovaným chováním obsazuje větší část replikačního prostoru, než pokud by zůstal v neexcitovaném stavu.

b) Spouští tím řadu mechanismů, které nutně vedou k evolučnímu zániku excitované mutace, pokud nedojde k jejímu uklidnění. (Různým způsobem, například i tím, že v logice přirozeného vývoje takto zasažená část hostitelů prohrává ve své soutěži s nezasaženou částí hostitelů a tím si náš virus zlikvidoval vlastní živnou půdu, jak to krásně ukazují modely založený na hrách typu "tragédie společné pastviny hrané s opakováním".)

K tomu řada otázek:

1. Může existovat "neviditelné" šíření našeho viru?

2. Co je příčinou toho, že se některé mutace začnou chovat nekooperativně?

3 Mohl původní impuls vzniknout umělou mutací viru, nebo je pravděpodobnější, že se setkaly dvě mutace, které na sebe reagovaly nekooperativním chováním?

4. Mohou oscilace mutací vést k tomu, že se náš virus začne vracet ke kooperativnímu chování?

5. Které báze a které sekvence našeho viru jsou z tohoto hlediska významné?

Atd.

Patrně dá ještě hodně práce, než se podaří propojit koncepty vycházející z teorie evolučních her s prostředky mikrobiologie a jemnějšími daty o šíření infekce.

Poznámky:

1. Zdůrazňuji, že výše uvedený text jsou zatím jen hypotetické úvahy, jejichž závěry se nemusejí potvrdit.

2. Patrně je nutné brát v úvahu, že realita bude bohatší, že mezi viditelným a neviditelným šířením viru, excitovaným a neexcitovaným stavem či podobně nebudou existovat ostré hranice. "Přepínání" chování viru může probíhat z hlediska procentuálního složení populace viru velmi plynule.

3. Jeden z velmi důležitých závěrů výše prezentovaného pohledu je, že žádná "druhá vlna" (ani další) nemusí přijít. Mohou jen lokálně (a to i ve velkých regionech) vzniknout nebezpečná ohniska agresivní a dlouhodobě přetrvávající vícenákazy v excitovaném stavu. Právě zde je důležité to, jak se budou státy a jejich instituce chovat.

4. V otázkách virologie či mikrobiologie nejsem expert, proto uvítám další podněty (řadu jsem už obdržel a díky). Tady by neměla hrát roli profesní rivalita ("kdo je chytřejší"), jedná se o typický interdisciplinární pohled.

Náš virus se uklidňuje (začínáme ho "ochočovat")?:

"Koronavirus ztrácí na síle a stává se mnohem méně smrtícím. Uvedl to italský lékař Alberto Zangrillo, který je šéfem milánské nemocnice San Raffaele. Dodal, že někteří experti vyvolávají nadměrné obavy ohledně vyhlídek na druhou vlnu epidemie a že politici musejí zohlednit novou situaci. - "Ve skutečnosti již tento virus v Itálii klinicky neexistuje," řekl Zangrillo v rozhovoru s italskou televizí Rai. Upozornil, že vzorky z posledních deseti dnů ukázaly, že množství volného viru v krvi je zcela nepatrné ve srovnání se vzorky z doby před jedním či dvěma měsíci... - O zeslabování koronaviru nicméně v rozhovoru s agenturou ANSA hovořil i další italský lékař Matteo Bassetti, který je šéfem kliniky pro infekční nemoci v janovské nemocnici San Martino. "Virus dnes nemá stejnou sílu jako před dvěma měsíci," prohlásil. "Je jasné, že nemoc covid-19 je dnes jiná," dodal."

https://www.irozhlas.cz/zpravy-svet/koronavirus-je-stale-mene-smrtici-je-treba-se-navratit-k-normalnimu-zivotu_2006010751_tzr?fbclid=IwAR1mv6fEry1I-tc-gYRvm630Zxe822KWpu3p7jl6eVXTqHmR9FbbrX-q4CQ

Podle některých komentátorů však Zangrillo není příliš důvěryhodný. Uvidíme, jak dopadne italský experiment rozvolnění pohybu osob po celé Itálii.

Může to však být i určité znamení mého hlavního tvrzení, že největším nebezpečím jsou vícenakazy blízkými mutacemi, kdy náš virus rozehraje hry za "čistotu rasy", tedy svého kmene a zdivočí (dostane se do excitovaného stavu). Když není v excitovaném stavu, tak je obtížně zjistitelný. Bílé krvinky na něj nereagují a virus se množí velmi pomalu, přežívá v nízkých stavech, resp. koncentracích. Zkrátka - hraje kooperativní strategii při spásání pastviny (hostitele).

Co se děje ve světě:

Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:

https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Další významné zdroje o dění ve světě:

https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441

https://ourworldindata.org/coronavirus

První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.

Graf šíření mutuací:

https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114

Tyto stránky ukončily uveřejňování nových příspěvků, ale archiv zůstal. Důležitý je závěr, ke kterému dospěly.

Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:

https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19?fbclid=IwAR3kdxZhYD7krsZ_K-xrmwNkGlQMO5rsIjQe_0jAWZT___jH_9pV_KzA38c

Nejdůležitější je tento graf:

Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
(Pokračování)