COVI-kávička 31.5: 5 RF +8952 US +23290. Komentář

U nás, jak se zdá, je koronavirus již plně pod kontrolou a "ochočen" (nepropukají zdivočelé vícenákazy). Pokud nedojde k recidivě (a tu zatím nepředpokládám do uvolnění pohybu osob a případné "repatriaci" nové vícenákazy), není nijak zvlášť přínosné sledovat situaci v ČR. Pokud dojde ke změně, včas zareaguji. Proto je dobré zaměřit pozornost na ty země, kde se koronavirus ještě nedaří nejen ochočit, ale ani zkrotit. Za 30. květen:

Ruská federace: +8952nových případů

Spojené státy:  +23290 nových případů

Uvedené dva státy jsem si vybral k dennímu sledování nejen proto, že jsou největší, ale i proto, že v nich došlo k největšímu rozbujení vícenákaz. Bude zajímavé sledovat, jak se zde bude situace vyvíjet. Je to příběh s otevřeným koncem a hodně napoví o tom, jak náš virus funguje.

Pokud srovnáváme jednotlivé země mezi sebou, je nutné uvažovat různou metodiku a další faktory, které výsledek ovlivňují (např.

počet testů). K tomu se postupně dostanu. Důležité je však právě průběžně sledování, protože z časových řad lze vyčíst hodně i při odlišných metodikách.

Informace čerpám zejména z: https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Zde jsou přehledně uvedeny výsledky osmi zemí stažené 30. května dopoledne, které jsou z hlediska vývoje epidemie nejvýznamnější:

a) "Yesterday" - 29. května (s uvedením přírůstků) 

b) "Now" - 30. května, tj. dnes (zde budou přírůstky postupně naskakovat během dne)

Jak to vidím

Zásadní otázky týkající se "fungování našeho viru"

(Pozor! - Je to trochu náročnější text a chce to trochu něco vědět o teorii evolučních her. Ale je to hodně důležité.)

Při rozklíčování reality prostřednictvím abstraktních modelů je nejdůležitější kladení otázek ve správné posloupnosti, od těch nejjednodušších k odvozeným a složitějším. Takže:

1. Mutuje COVID-19, nebo jen "osciluje" kolem základní struktury RNA? To znamená:

a) Zaznamenali jsme evolučně stabilní odlišné mutace viru, které mají za následek odlišné chování našeho viru?

nebo

b) Zatím zaznamenáváme jen "bodově" odlišné mutace (tj. mutace, při nichž se mění jen jednotlivé báze), přičemž tyto mutace nejsou evolučně stabilní, vracejí se do původních stavů ("oscilují" kolem základní verze, v tomto smyslu je náš virus evolučně stabilní?

2. Pokud je virus, jehož replikace je založena na DNA, evolučně stabilní ve smyslu alternativy 1b), čím to vysvětlit? Přesněji:

a) Je to v důsledku "statické" stability DNA, tím že z nějakých důvodů vytváří silné vazby mezi jednotlivými bázemi?

nebo

b) Je to spojené s logikou "oscilací", kdy náhodně vzniklé mutace, které by mohly vytvořit evolučně stabilní alternativu, vyvolávají změnu chování ostatních virů přítomných v hostiteli tak, aby "kandidáti" na evoluční alternativu byli eliminováni přirozeným výběrem?

3. Pokud je náš virus evolučně stabilní, může existovat jeho evoluční stabilita na jiném základě než na ochraně základní verze (bazálního stavu) našeho viru, který preferuje kooperativní strategii při "spásání pastviny", tj. při své replikaci v těle hostitele? Konkrétně:

- Může virus sám sebe evolučně "zakonzervovat" na neomezené dlouhou dobu i v případě, že nepreferuje kooperativní strategii?

nebo

- V logice dlouhodobého přirozeného výběru se nutně prosadila jako dominantní strategie kooperace základní verze našeho viru a mutační oscilace slouží jen k tomu, aby se dominantní báze zakonzervovala, tj. slouží k eliminování evolučních alternativ s odlišnou strategií?

4. Pokud je dominantní strategií našeho viru kooperace, tak:

a) Odlišné chování je jen nahodilým excesem, který z hlediska dlouhodobého vývoje není evolučně stabilní?

nebo

b) Náš virus je schopný reagovat na "rychlé spásání pastviny", tj. na to, že se objevují bodové mutace s odlišnou strategií, a sám spouští nekooperativní chování, aby uchránil základní verzi DNA? (Jednak tím zabrání tomu, aby mutace ohrožující stabilitu viru převládla a stala se evoluční alternativou, jednak tím urychlí vyřazení nositelů nekooperativních strategií z dlouhodobého vývoje.)

5. Pokud se náš virus chová ve smyslu bodu 4b), tak nebezpečné jsou

a) Jakékoli nákazy záleží jen na množství viru, které do hostitele pronikne, dále pak na stavu organismu hostitele?

nebo

b) Nebezpečné jsou jen vícenákazy určitého typu, na které náš virus reaguje na základě své evoluční "zkušenosti", dostává se do excitovaného stavu nekooperativních strategií, propukají nebezpečné formy onemocnění, aby došlo k evolučnímu zániku mutace, která proces spustila?

K tomu něco méně náročného: Tady si můžete prohlédnout nádhernou animaci COVID-19, dokonce se mu podívat přímo "do pajšlu":

Animace koronaviru: https://www.visual-science.com/projects/sars-cov-2/animation/?fbclid=IwAR08Bzyh8eI2oSv4RBW94UPZ7P696bmsOLHf0Xrcqxva8k0fIW8ooCUCSk8

Co se děje ve světě:

Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:

https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

Další významné zdroje o dění ve světě:

https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441

https://ourworldindata.org/coronavirus

První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.

Graf šíření mutuací:

https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114

Tyto stránky ukončily uveřejňování nových příspěvků, ale archiv zůstal. Důležitý je závěr, ke kterému dospěly.

Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:

https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19?fbclid=IwAR3kdxZhYD7krsZ_K-xrmwNkGlQMO5rsIjQe_0jAWZT___jH_9pV_KzA38c

Nejdůležitější je tento graf:

Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
(Pokračování)