Radim Valenčík
Vysokoškolský učitel - Vysoká škola finanční a správní, první soukromá ekonomická univerzita
COVI-kávička 21.6.: RF +7889 US +33388. Komentář
U nás, jak se zdá, je koronavirus již plně pod kontrolou a "ochočen" (nepropukají zdivočelé vícenákazy). Pokud nedojde k recidivě (a tu zatím nepředpokládám do uvolnění pohybu osob a případné "repatriaci" nové vícenákazy), není nijak zvlášť přínosné sledovat situaci v ČR. Pokud dojde ke změně, včas zareaguji. Proto je dobré zaměřit pozornost na ty země, kde se koronavirus ještě nedaří nejen ochočit, ale ani zkrotit.
Ruská federace: +7889 nových případů (o 83 menší přírůstek než předcházející den).
Spojené státy: +33388 nových případů (o 150 menší přírůstek než předcházející den). Stále velmi vysoké, zůstává na hodnotách o polovinu vyšších, než několik týdn§ před tím. US mají velký problém.
Uvedené dva státy jsem si vybral k dennímu sledování nejen proto, že jsou největší, ale i proto, že v nich došlo k největšímu rozbujení vícenákaz. Bude zajímavé sledovat, jak se zde bude situace vyvíjet. Je to příběh s otevřeným koncem a hodně napoví o tom, jak náš virus funguje.
RF již několik dní na mírně nižších hodnotách. V US vyskočily přírůstku již téměř týden na o třetinu až polovinu vyšší, než byl dlouhodobý průměr nových případů.
Vysoký počet přírůstků rovněž v Brazílii, nebezpečně roste Indie, Pakistán, Jihoafrická republika.
Pokud srovnáváme jednotlivé země mezi sebou, je nutné uvažovat různou metodiku a další faktory, které výsledek ovlivňují (např. počet testů). K tomu se postupně dostanu. Důležité je však právě průběžně sledování, protože z časových řad lze vyčíst hodně i při odlišných metodikách.
Informace čerpám zejména z: https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Jak to vidím
Jak funguje náš virus – I. část
Postupně je zpracovávám pro potřeby populárního výkladu, jak náš virus funguje. Je jiný. Původně jsem chtěl nové poznatky vycházející z konfrontace mikrobiologické analýzy s teorií evolučních her uveřejnit později. Poměrně dramatický vývoj spojený s nástupem recidiv šíření nákazy a její akcelerace v různých částech světa mě přiměl k tomu, abych formuloval dílčí výsledky co nejdříve. Jak se totiž zdá, bude muset celý svět revidovat svůj dosavadní přístup. K tomu je ovšem nutné pochopit, jak náš virus funguje. Pokusím se to co nejnázorněji vyložit v několika bodech:
1. Náš virus je výsledkem velmi dlouhodobého vývoje. Jeho předci tu mohli být už před miliardou let. V podobě blízké současné se s nimi setkali již brontosauři.
2. Lze předpokládat, že během dlouhodobého vývoje našeho viru a jeho příbuzných se "vyladila" strategie jejich chování k evolučně stabilní strategii.
3. Evolučně stabilní strategie je pojem z teorie her. Platí pro ni následující: Když se některá mutace odchýlí od strategie svého kmene, kterou přijali všichni ostatní členové kmene, je tato mutace evolučně neúspěšná (postupně zanikne).
4. Náš koronavirus a jeho příbuzní takovou strategii patrně mají a patrně je velmi podobná mezi nimi navzájem (nemusí být v některých parametrech shodná).
5. Cílem teorie je:
- Pomocí nástrojů teorie her popsat "zvnějšku" (z projevů toho, jak virus funguje a jak se chová) co nejpřesněji evolučně stabilní strategii našeho viru (i jemu podobných).
- Pomocí nástrojů mikrobiologie na úrovni chemických reakcí a popisu funkce mikrobiologických entit odhalit, jak je evolučně stabilní strategie v našem viru fixována a jak funguje.
(Jde o to, aby se dva různé teoretické přístupy potkaly.)
6. Vhodným teoretickým východiskem pro hledání konkrétní podoby evolučně stabilní strategie našeho viru je model hry "tragédie společné pastviny". (Jedná se o dvoumaticovou hru dvou hráčů; jedním z hráčů je jeden pastevec, druhým jsou všichni ostatní pastevci, hráči mají dvě strategie – dodržet pravidlo spásání, nedodržet pravidlo spásání; pořadí výplat hráče "já": já nedodržím pravidlo, všichni ostatní dodrží > všichni dodržíme pravidlo > všichni nedodržíme pravidlo > já dodržím pravidlo, všichni ostatní nedodrží pravidlo.)
[O této hře bylo napsáno velmi mnoho, zájemce o podrobnosti odkazuji na snadno dostupné zdroje z internetu.]
7. Základem evolučně stabilní strategie je dodržení dohod o spásání pastviny, v našem případě "šetrné" chování našeho viru k hostiteli. S největší pravděpodobností tak "pomalé spásání" (zde se terminologie výchozí interpretace hry typu "tragédie společné pastviny" ukazuje jako zvlášť vhodná), aby přítomnost viru toleroval i imunitní systém hostitele.
8. To předpokládá, že existují mechanismy, které vedou náš virus k tomu, aby vysoce selektivním způsobem volil buňky, které napadne (a zasáhl tak jen malou část buněk, například nějak poškozených, čím může docházet i k jeho prospěšnému působení, což je běžné – původní parazit se mění v symbiotika, protože jde o přežití nejen jeho, ale i jeho hostitele v konkurenci s ostatními organismy).
9. Takovéto formy koronaviru budou patrně v přírodě velmi rozšířené, jejich empirické odhalení není jednoduché, protože nevyvolávají žádné příznaky ani nevedou k tvorbě protilátek.
10. Hlavní otázkou z mikrobiologického hlediska je, co k této vysoké selektivitě výběru napadených buněk vede. Vysokou selektivitu můžeme považovat za volbu kooperativní strategie pomalého spásání. Je výsledkem evoluce (tj. nejde o to, "co všechno je náš virus schopen napadnout", ale to to "proč nenapadá mnohem více buněk mírně odlišného typu").
11. Problém evolučně stabilní strategie je pak spojen s otázkou, co má dělat celý kmen, když se objeví nekooperativní chování, tedy když se objeví mutace porušující pravidla spásání evolučně zakotvená ve většinové populaci.
12. Obrana proti porušení pravidel musí být velmi účinná a kódovaná dlouhodobým vývojem našeho viru.
S tím souvisejí dvě otázky:
- Co způsobilo, že se náš virus začas chovat agresivně?
- Jakým způsobem může náš virus v rámci své evolučně stabilní strategie eliminovat mutace, které narušují jeho evolučně stabilní strategii.
Jak uvidíme v dalším pokračování, jsou obě otázky rubem a lícem jedné mince.
Pro názornou představu ještě fylogenetický strom savčích ACE2 proteinů. Sekvence ACE2 z celkem 42 savců. Fylogenetický strom byl sestrojen pomocí vývojového modelu JTT s využitím metody maximální pravděpodobnosti. Červená představuje druh, jehož ACE2 se nemůže vázat na S (hrotový) protein, a zelená je druh, jehož ACE2 se sdružuje s S (hrotovým) proteinem.
Z obrázku je zřejmé obrovská rozmanitost možností, které je nutné uvážit, když hledáme odpověď na výše uvedené otázky.
(Pokračování zítra)
Důležité teoretické zdroje:
Následující tři odkazy dávají představu o tom, co víme o fungování našeho viru a virů s ním spřízněných:
Nákaza na jatkách v Německu
Ve zprávách ZDF 18.06.2016 06:05 s odvoláním na zdroje AFP, dpa, zde:
https://www.zdf.de/nachrichten/politik/coronavirus-fleischbetriebe-werkvertraege-100.html
Po vypuknutí choroby Corona na jatkách Tönnies požaduje odborový svaz potravin okamžitý zákaz pracovních smluv (obdoba našeho "švarcsystému") v masném průmyslu.
Po obnovení ohniska koronového viru v německé masné společnosti požadovala odborová organizace "Lebensmittel-Genuss-Gaststätten" (NGG) okamžitý zákaz pracovních smluv v tomto odvětví. "Tento chorý systém" musí být konečně ukončen, řekl viceprezident NGG Freddy Adjan novinám "Funke media group".
Zákaz federálních vlád na pracovních smlouvách v masném průmyslu musí být "proveden bez ohrožení legislativního procesu". V masové skupině Tönnies v Rheda-Wiedenbrück v Severním Porýní-Vestfálsku bylo nedávno na virus pozitivně testováno 657 zaměstnanců, jak oznámil okres Gütersloh.
V okrese Gütersloh bylo téměř 700 zaměstnanců v továrně na maso Tönnies testováno na přítomnost koronového viru pozitivně. Místní školy a školky jsou nyní uzavřeny.
Okres okamžitě uzavřel všechny školy a školky až do letních prázdnin. Všichni infikovaní lidé a jejich kontakty byli v karanténě.
V posledních několika měsících došlo u zaměstnanců německých masných továren k několika ohniskům koronavírusů. Spolková vláda proto zavedla nové požadavky pro toto odvětví před čtyřmi týdny. Mimo jiné existují plány zakázat pracovní smlouvy od 1. ledna 2021.
Podle toho by mělo být povoleno porážet a demontovat zvířata pouze zaměstnanci jejich vlastní společnosti. Kontrakty na práce v tomto oboru upadly, protože zaměstnanci subdodavatelů jsou často zaměstnáni za nízké mzdy a s dlouhou pracovní dobou.
Kritizováno je také umístění těchto zaměstnanců v těsném společném ubytovacím zařízení. Adjan uvedl, že ohniska koronaviry jsou zjevně spojeny s "katastrofickými pracovními a životními podmínkami pro většinou smluvních pracovníků z východní Evropy".
Prezidentka Federální asociace průmyslu masných výrobků Sarah Dhem byla skeptická, pokud jde o zákaz spolkové vlády týkající se pracovních smluv v tomto odvětví lze snadno implementovat.
Pokud by takové smlouvy byly zakázány, některé společnosti "by z krátkodobého hlediska pravděpodobně čelily značným personálním problémům", řekla "Neue Osnabrücker Zeitung". Váš průmysl nemůže platit vysoké hodinové mzdy, jako jsou výrobci automobilů.
Zatímco školy a školky se teprve nyní pomalu otevírají, jatka fungují "jako by se nic nestalo," řekla zemědělská expertka Greenpeace Stephanie Töwe k novinám Funke. Provozovatelé přijímají riziko infekce pro zaměstnance i pro obyvatele oblasti "tak, aby neohrozili výrobu levného masa".
K tomu:
1. Německo zdaleka není bez problému. 657 pozitivně testovaných je víc než dost.
2. Bylo by zajímavé srovnat postup naší a německé vlády.
3. Zde jsou zcela zjevné ekonomické příčiny ("neohrozit výrobu levného masa") [U nás bez problémů zdražíme vejce důchodcům a dalším "ohroženým druhům"), jen aby chudáci slepice nemusely žít v klecích.]
4. Prostřednictvím přenosu přes zahraniční pracovníky "z východu" může snadno dojít k recidivám epidemie u nás; nelze podceňovat.
5. Přínosné z hlediska pochopení logiky reprodukce viru a jeho evoluční strategie.
Co se děje ve světě:
Zde je nejlepší zdroj s nejčerstvějšími informacemi:
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Další významné zdroje o dění ve světě:
https://www.ft.com/content/a26fbf7e-48f8-11ea-aeb3-955839e06441
https://ourworldindata.org/coronavirus
První z odkazů přebírá Financial Times. Je na něm mj. vyjádřeno i to, jak vzrostl počet úmrtí v jednotlivých zemích oproti tříletému průměru. Na to by se měli podívat všichni popírači a chřipkaři.
Graf šíření mutuací:
https://nextstrain.org/ncov/global?gmax=19896&gmin=15114
Tyto stránky ukončily uveřejňování nových příspěvků, ale archiv zůstal. Důležitý je závěr, ke kterému dospěly.
Podrobněji lze vývoj v ČR sledovat zde:
Nejdůležitější je tento graf:
Na závěr: Děkuji všem, kteří mi zasláním materiálů a doporučeními pomáhají. Rád uvedu jména, pokud dají souhlas.
(Pokračování)
Komentáře
| RE: COVI-kávička 21.6.: RF +7889 US +33388. Komentář | maxim 1 | 21. 06. 2020 - 22:57 |